Ayuda con el concepto de
"secuencia consenso"

Del Diccionario de la Real Academia Española:
 
consenso.
(Del lat. consensus).
1. m. Acuerdo producido por consentimiento entre todos los miembros de un grupo o entre varios grupos.
Una "secuencia consenso" especifica cuáles son los elementos comunes a las secuencias encontradas en distintas situaciones (genes, especies...) para una misma función. La mera existencia de ese consenso, es decir, la presencia sistemática de esos elementos comunes, es informativa porque nos indica que son importantes para la función.

Ejemplo:
Al estudiar la secuencia del DNA en la región corriente arriba del punto de inicio de la transcripción para 60 genes que codifican proteínas de diversos vertebrados, se encontraron los nucleósidos con las siguientes frecuencias:
 
Frecuencia (%) con la que aparece en esa posición cada nucleósido
A 17 22 13 7 97 7 85 63 88 50 33 18
T 17 27 10 82 2 93 10 37 10 33 12 15
C 50 38 53 2 2 0 0 0 0 13 38 48
G 15 13 23 10 0 0 5 0 2 3 17 18
Se señalan (en amarillo) las frecuencias mayores.
Éstas definen el consenso:
T A T A A
T 		 A
que, en este caso, recibe el nombre de "caja TATA eucariótica" (o caja de Hogness).
(En las 3 primeras y 3 últimas posiciones ningún nucleósido es particularmente frecuente, no hay consenso).		 (distancia variable hasta el nucleósido +1: 
de 18 a 26 nt)
 
 
 
 
 

.

 nucleósido +1: comienzo de la transcripción
 
 
 
 
 

.

Otro ejemplo:
Para otro grupo de genes eucarióticos, la región que rodea al punto de inicio de la transcripción muestra las siguientes frecuencias:
 
Frecuencia (%) con la que aparece en esa posición cada nucleósido 
posición -2 -1 +1 +2 +3 +4 +5
A 7 2 94 37 36 5 7
T 40 55 1 25 51 40 37
C 48 40 3 19 5 43 51
G 5 3 2 19 8 12 5
Se señalan (en amarillo) las frecuencias mayores.
Éstas definen el consenso:
Y Y A N T
A 		 Y Y
que, en este caso, recibe el nombre de "secuencia iniciadora Inr".
En la posición +2 ningún nucleósido es particularmente frecuente, no hay consenso: N representa cualquiera de los 4.
En las posiciones -2, -1, +4 y +5 predominan T o C: se abrevian como 'Y', para indicar nucleótido pirimidínico (pYrimidine, en inglés). Para nucleótidos puRínicos se usa 'R'.


Adaptado de Molecular Cell Biology, 4th. edn., Lodish et al. (2000), p.365.