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Páginas de complemento al estudio de bioquímica y biología molecular


Esta es la página de acceso con explicaciones detalladas; alternativamente, puedes usar la página principal, con accesos rápidos.

Enlaces externos recomendados:

El lenguaje científico:

libro y pluma

1. Vocabulario inglés-español de bioquímica y biología molecular
(G. Claros, V. Saladrigas y D. González-Halphen)

2. Normas para la escritura científica en español
(G. Claros)

3. Colección de acrónimos
(E. Castro)

portada del libro4. Ideas, reglas y consejos para traducir y redactar textos científicos en español
(G. Claros)

Cómo utilizar Jmol para estudiar y presentar estructuras moleculares. Volumen 1: aprendiendo a usar Jmol (niveles básico e intermedio)
portada del libro
Texto Ilustrado de Biología Molecular e Ingeniería Genética: Conceptos, Técnicas y Aplicaciones en Ciencias de la Salud
portada del libro
Sede web del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular
Sede web de la asignatura Biología Molecular e Ingeniería Genética
BioROM
«Índice mundial de recursos de visualización molecular»
(Eric Martz y Trevor D. Kramer)
«Modelos moleculares»
(Enrique Battaner, Univ. Salamanca)
«Estructura de macromoléculas»
(Jesús Sanz, Univ. Miguel Hernández, Elche)
«Alguna Bioquímica en la Red»
(José Miguel Fernández, Univ. Granada)
«Aula Virtual de Biología»
(Univ. Murcia)
Modelo molecular «Insulina»
(Janneth Vásquez, Academia Colombina de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales)

Información general de estas páginas:

   Las secciones "Biomodel" contienen modelos moleculares en movimiento e interactivos que, junto con texto explicativo, ilustran la estructura tridimensional de las biomoléculas.
   Para ver Biomodel-1 a -5 se necesita tener instalado Java y se recomienda un navegador moderno.
   Como alternativa, existen versiones antiguas de Biomodel-1 a -5 que utilizan el conector (plug-in) Chime; para ellas es preciso instalar dicho conector y se recomienda Firefox. Para Firefox y otros navegadores, consulta la sección técnica.
  Las otras secciones tienen información diversa y algunas requieren también conectores apropiados para ver las películas (todos ellos pueden conseguirse gratuitamente). 

Novedades
Novedades (13/10/11) e historia de esta sede web.
Información
Presentación de las secciones Biomodel-1 a -5, información sobre los programas usados y sobre la configuración necesaria del ordenador, enlaces a otras páginas web relacionadas.
Páginas técnicas
Sección técnica: configuración del ordenador.
Páginas técnicas
Sección de autoría: herramientas, trucos... para preparar páginas web.
Páginas técnicas
Sección técnica de autoría: preparación de páginas con Jmol.
1.

Biomodel-1: complementos visuales informáticos para Bioquímica y para Biología Molecular e Ingeniería Genética (nivel universitario)

Ácidos nucleicos, proteínas y sus interacciones mutuas.

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Versión con Jmol. recomendada
Requiere tener instalado Java ayuda (no hay que instalar Jmol); compatible con todos los navegadores modernos WinXP MacOS Linux.
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Versión antigua con Chime.
Requiere tener instalado el conector Chimeayuda; se recomienda Netscape 4.x.
WinXP es también bastante compatible con Netscape 7, Mozilla y Firefox, y parcialmente con Internet Explorer.
MacOS sólo en modo Mac Classic con Netscape 4.x.
Linux no compatible (salvo emuladores).
2.

Biomodel-2: más complementos visuales informáticos para Bioquímica

empezar

El mundo de los lípidos.
Estructura y propiedades de lípidos.

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Modelo de bicapa lipídica: colesterol, fosfolípidos, bicapa y canal de gramicidina. (Versión con Jmol. recomendada)
Requiere tener instalado Java ayuda (no hay que instalar Jmol); compatible con todos los navegadores modernos WinXP MacOS Linux.

méritoBiomodel-2 ha sido incluido (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.

empezar
Modelo de bicapa lipídica: colesterol, fosfolípidos, bicapa y canal de gramicidina. (Versión antigua con Chime.)
Requiere tener instalado el conector Chimeayuda; se recomienda Netscape 4.x.
WinXP es también bastante compatible con Netscape 7, Mozilla y Firefox, y parcialmente con Internet Explorer.
MacOS sólo en modo Mac Classic con Netscape 4.x.
Linux no compatible (salvo emuladores).
3.

Biomodel-3: complementos visuales informáticos para bioquímica en enseñanza secundaria

Versión simplificada. Incluye la estructura tridimensional de algunos ejemplos de glúcidos, lípidos, vitaminas, aminoácidos, péptidos, proteínas, nucleótidos y ácidos nucleicos.

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Versión con Jmol. recomendada
Requiere tener instalado Java ayuda (no hay que instalar Jmol); compatible con todos los navegadores modernos WinXP MacOS Linux.

premioBiomodel-3 ha recibido un tercer premio en el concurso 2006 del Ministerio de Educación y Ciencia de España para materiales educativos curriculares en soporte electrónico que puedan ser utilizados y difundidos en internet.

méritoBiomodel-3 ha sido incluido (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.

empezar
Versión antigua con Chime.
Requiere tener instalado el conector Chimeayuda; se recomienda Netscape 4.x.
WinXP es también bastante compatible con Netscape 7, Mozilla y Firefox, y parcialmente con Internet Explorer.
MacOS sólo en modo Mac Classic con Netscape 4.x.
Linux no compatible (salvo emuladores).

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4.

Biomodel-4: estructura del DNA

Guía para el estudio mediante la investigación autónoma.

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Versión con Jmol. recomendada
Requiere tener instalado Java ayuda (no hay que instalar Jmol); compatible con todos los navegadores modernos WinXP MacOS Linux.

méritoBiomodel-4 ha sido incluido (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.

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Versión antigua con Chime.
Requiere tener instalado el conector Chimeayuda; se recomienda Netscape 4.x.
WinXP es también bastante compatible con Netscape 7, Mozilla y Firefox, y parcialmente con Internet Explorer.
MacOS sólo en modo Mac Classic con Netscape 4.x.
Linux no compatible (salvo emuladores).

   Esta guía para la estructura del DNA está disponible en español, inglés, portugués, francés, alemán, italiano, rumano y polaco.

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5.

Biomodel-5: biopolímeros

Material complementario y otras biomoléculas menos habituales.

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Versión con Jmol. recomendada
Requiere tener instalado Java ayuda (no hay que instalar Jmol); compatible con todos los navegadores modernos WinXP MacOS Linux.

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Versión antigua con Chime.
Requiere tener instalado el conector Chimeayuda; se recomienda Netscape 4.x.
WinXP es también bastante compatible con Netscape 7, Mozilla y Firefox, y parcialmente con Internet Explorer.
MacOS sólo en modo Mac Classic con Netscape 4.x.
Linux no compatible (salvo emuladores).

   Esta guía para la estructura del DNA está disponible en español, inglés, portugués, francés, alemán, italiano y rumano.

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A.

Proyecto Genoma Humano

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Documental en vídeo
B.

Citogenética: el estudio de los cromosomas

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Información general de citogenética: Morfología de los cromosomas, cariotipo, análisis cromosómico, anomalías cromosómicas, estudio citogenético por tinción de bandas y por fluorescencia (técnica FISH).
   ( Por cortesía de  Dave McDonald  y  Dynagene Cytogenetics Laboratory )

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Citogenética clínica: Introducción a la Citogenética y análisis cromosómico. Cariotipo, tipos de bandeado, FISH. Anomalías cromosómicas. Múltiples fotos y dibujos animados de cariotipos anormales.
   ( Por cortesía de   Marshall Horwitz, University of Washington School of Medicine )

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Genes, cromosomas y meiosis: Definiciones y figuras (genotipo, fenotipo, gen, alelo, cromosoma, cromátida). El proceso de meiosis: figuras y dibujo animado; meiosis I y II.
   ( Por cortesía de   Marshall Horwitz, University of Washington School of Medicine )

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Genética del cáncer: Oncogenes, genes oncosupresores y genes "mutadores" (genes de reparación o del ciclo celular)
   ( Por cortesía de   Marshall Horwitz, University of Washington School of Medicine ) subir

C.

diagrama circular del códigoCódigo genético

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En representación circular (diagrama del "sol naciente")
D.

Esquemas animados de técnicas y procesos bioquímicos

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Estructura: 

Agua y tampones. Carbohidratos. Proteínas. DNA. Membranas.

Procesos: 

Enzimas. Metabolismo. Transporte intracelular. Replicación. Transcripción. Maduración del RNA. Traducción. Maduración de proteínas. Procesos celulares.

Técnicas: 

Centrifugación. Cromatografía. Electroforesis. Hibridación. DNA recombinado.

E.

Estereoisomería de biomoléculas

(Autoevaluación interactiva con modelos tridimensionales)

  • Isomería óptica: enantiómeros, nomenclatura R-S, fórmulas de proyección de Fischer, diastereómeros.
  • Monosacáridos: nomenclaturas D-L y R-S, fórmulas de Fischer, de Newman, de Haworth, nomenclatura alfa-beta.
  • Disacáridos y polisacáridos.
  • Aminoácidos y péptidos
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Versión con Jmol. recomendada
Requiere tener instalado Java ayuda (no hay que instalar Jmol); compatible con todos los navegadores modernos WinXP MacOS Linux.

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Versión antigua con Chime.
Requiere tener instalado el conector Chimeayuda; se recomienda Netscape 4.x.
WinXP es también bastante compatible con Netscape 7, Mozilla y Firefox, y parcialmente con Internet Explorer.
MacOS sólo en modo Mac Classic con Netscape 4.x.
Linux no compatible (salvo emuladores).

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F.

Páginas en español de «El Proyecto Biológico» (originado en la Universidad de Arizona)

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Versión local en español de las secciones

  • Bioquímica (completa)
  • Biología Molecular (completa)
  • Biología Humana ("ADN en medicina legal")

Traductores: Angel Herráez, Mª Cristina Tejedor y Pilar Sancho (UAH), Isabel Carrero (UVa), Jesús Salgado (UV). subir

G.

Estudio de los ácidos nucleicos

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Análisis electroforético de DNA plasmídico

(Comentario guiado)

  • Plásmidos, su superenrollamiento y su análisis mediante electroforesis.
  • Digestión parcial de un plásmido usando enzimas de restricción y análisis electroforético.
  • Interpretación de los geles e introducción a la elaboración de un mapa de restricción.

Superenrollamiento del DNA

(Módulo de aprendizaje activo, nivel medio y avanzado)

y enlaces cruzados a material dentro de otras secciones de Biomodel.

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H.

Estructura del agua: enlaces de hidrógeno

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Enlaces en el agua y en el hielo.

Simulación de la condensación de moléculas de agua en una gotícula.

Simulación de la transición agua-hielo.

Incluye un modelo molecular animado, generado mediante minimización energética.

méritoEste módulo (v.1) ha sido incluido (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.

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I.

Temas diversos

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Radiactividad, ácido-base y oxidorreducción

Contenidos de los temas en forma de presentación, acompañados de actividades y ejercicios.

Elaborado en colaboración con la Universidad Nacional del Nordeste (Corrientes, Argentina)

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J.

Aplicaciones químicas

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Consigue estructuras tridimensionales a partir del nombre.

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Brico-moléculas: dibuja tu estructura y consigue el modelo tridimensional.

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L.

Laboratorios virtuales

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Simuladores de técnicas de laboratorio

  • Ejercicios de autoevaluación sobre procedimientos básicos de cálculo en el laboratorio: diluciones, conversión de unidades, absorbancia y concentración.
  • Simuladores de electroforesis
    • de proteínas en gel de poliacrilamida con SDS (SDS-PAGE)
    • de proteínas séricas sobre acetato de celulosa
    • de isoenzimas de LDH sobre acetato de celulosa
    • de DNA en gel de agarosa
    • de DNA en gel de poliacrilamida para secuenciación
  • Laboratorio virtual de biología molecular
    • digestión de DNA con enzimas de restricción
    • análisis electroforético de los fragmentos
    • secuenciación de DNA por el método de didesoxinucleótidos
  • Simulador de espectros
    • de absorción ultravioleta de mezclas de proteínas y DNA
    • de dicroísmo circular de proteínas, en función de su estructura secundaria
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M.

Metabolismo

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Materiales diversos para ilustrar algunos aspectos del metabolismo.

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X.

Ejercicios de autoevaluación

1) de estereoisomería: véase más arribasubir

2) véase también “El Proyecto Biológico”subir

3) Preguntas, ejercicios y problemas, con respuestas y comentarios, correspondientes a las asignaturas de la Licenciatura en Farmacia, en la Universidad de Alcalá: Biología Molecular e Ingeniería Genética y Bioquímica Clínica y Patología Molecular Humana.
Puedes encontrarlos en la página web del Departamento:visitar subir

Y.

Colección de enlaces para bioquímica y biología molecular

Mostrar (en una ventana nueva)

Enlaces a páginas web útiles para la enseñanza y el aprendizaje de la Bioquímica y Biología Molecular.
(Esta colección de enlaces es una parte del proyecto BioROM) subir

Z.

Protein Explorer en español

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Potente programa de uso sencillo para investigar la estructura de macromoléculas. Copyright © 2004 Eric Martz, traducido al español por Gabriel Pons (). subir

  

Ideas para el futuro:

Proteínas gigantes

Estructura de glúcidos

... ¿Alguna sugerencia?

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Esta es la página con explicaciones detalladas del sitio web "Biomodel", mantenido por
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Profesor Titular de Bioquímica y Biología Molecular
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Alcalá escudo UAH (Alcalá de Henares, Madrid, España)
Dirección principal: http://biomodel.uah.es


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Navegador de internet:

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Si tienes problema con alguna configuración concreta de navegador, sistema operativo, etc., me gustaría saberlo para intentar una solución; indica los detallas específicos: problema encontrado, página que falla, sistema operativo, versión del navegador...


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