Información general de estas páginas:
Las secciones "Biomodel" contienen
modelos moleculares en movimiento e interactivos que, junto con texto explicativo,
ilustran la estructura tridimensional de las biomoléculas.
Para ver Biomodel-1 a -5 se necesita tener instalado Java y se recomienda un navegador moderno.
Como alternativa, existen versiones antiguas de Biomodel-1 a -5 que utilizan el conector (plug-in) Chime; para ellas es preciso instalar dicho conector y se recomienda Netscape v.4 o Firefox. Para Firefox y otros navegadores, consulta la sección técnica.
Las otras secciones tienen información diversa y algunas
requieren también conectores apropiados para ver las películas (todos ellos pueden conseguirse gratuitamente). |
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Novedades (21/12/09) |
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Presentación de las secciones Biomodel-1 a -5, información
sobre los programas usados y sobre la configuración
necesaria del ordenador,
enlaces a otras páginas web relacionadas. |
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Sección técnica: configuración del ordenador. |
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Sección de autoría: herramientas, trucos... para preparar páginas web. |
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Sección técnica de autoría: preparación de páginas con Jmol. |
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1.
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Biomodel-1: complementos visuales informáticos para Bioquímica
y
para Biología Molecular e Ingeniería Genética
(nivel universitario)
Ácidos nucleicos, proteínas y sus interacciones
mutuas.
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Versión con Jmol. recomendada
Requiere tener instalado Java  (no hay que instalar Jmol); compatible con todos los navegadores modernos .gif)   .
Incluye estructura del ribosoma. |
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Versión con Chime.
Requiere tener instalado el conector Chime; se recomienda Netscape 4.x.
es también bastante compatible con Netscape 7, Mozilla y Firefox, y parcialmente con Internet Explorer.
sólo en modo Mac Classic con Netscape 4.x.
no compatible (salvo simuladores). |
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2.
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Biomodel-2: más complementos visuales informáticos para Bioquímica
Modelo de bicapa lipídica: colesterol, fosfolípidos, bicapa y canal de gramicidina.
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3.
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Biomodel-3: complementos visuales informáticos para bioquímica
en enseñanza secundaria
Versión simplificada. Incluye la estructura tridimensional
de algunos ejemplos de glúcidos, lípidos, vitaminas, aminoácidos,
péptidos, proteínas, nucleótidos y ácidos nucleicos.
¿Quieres una copia? Envía un
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4.
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Biomodel-4: estructura del DNA
Guía para el estudio mediante la investigación autónoma.
Esta guía para la estructura del DNA está disponible en español, inglés, portugués, francés, alemán, italiano y rumano.
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5.
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Biomodel-5: biopolímeros
Material complementario y otras biomoléculas menos habituales.
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| A.
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Proyecto Genoma Humano
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B. |
Citogenética: el estudio de los cromosomas
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Información general de citogenética
: Morfología de los cromosomas, cariotipo, análisis cromosómico,
anomalías cromosómicas, estudio citogenético por tinción
de bandas y por fluorescencia (técnica FISH).
(
Por cortesía de Dave McDonald
y Dynagene Cytogenetics Laboratory )
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Citogenética clínica
: Introducción a la Citogenética y análisis cromosómico.
Cariotipo, tipos de bandeado, FISH. Anomalías cromosómicas.
Múltiples fotos y dibujos animados de cariotipos anormales.
( Por cortesía de Marshall Horwitz,
University of Washington School of Medicine )
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Genes, cromosomas y meiosis
: Definiciones y figuras (genotipo, fenotipo, gen, alelo, cromosoma, cromátida).
El proceso de meiosis: figuras y dibujo animado; meiosis I y II.
( Por cortesía de Marshall Horwitz,
University of Washington School of Medicine )
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Genética del cáncer
: Oncogenes, genes oncosupresores y genes "mutadores" (genes de
reparación o del ciclo celular)
( Por cortesía de Marshall Horwitz,
University of Washington School of Medicine )
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| C.
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 Código
genético
En representación circular (diagrama del "sol naciente")
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| D.
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Esquemas animados de técnicas y procesos
bioquímicos
Estructura:
Agua y tampones. Carbohidratos. Proteínas. DNA. Membranas.
Procesos:
Enzimas. Metabolismo. Transporte intracelular. Replicación.
Transcripción. Maduración del RNA. Traducción. Maduración
de proteínas. Procesos celulares.
Técnicas:
Centrifugación. Cromatografía. Electroforesis. Hibridación. DNA recombinado.
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| E. |
Estereoisomería de biomoléculas
(Autoevaluación interactiva con modelos tridimensionales)
- Isomería óptica: enantiómeros, nomenclatura R-S, fórmulas de proyección de Fischer, diastereómeros.
- Monosacáridos: nomenclaturas D-L y R-S, fórmulas de Fischer, de Newman, de Haworth, nomenclatura alfa-beta.
- Disacáridos y polisacáridos.
- Aminoácidos y péptidos
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Versión con Jmol. recomendada
Requiere tener instalado Java (no hay que instalar Jmol); compatible con todos los navegadores modernos . |
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Versión con Chime.
Requiere tener instalado el conector Chime; se recomienda Netscape 4.x.
es también bastante compatible con Netscape 7, Mozilla y Firefox, y parcialmente con Internet Explorer.
sólo en modo Mac Classic con Netscape 4.x.
no compatible (salvo simuladores). |
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| F.
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Páginas en español de «El Proyecto
Biológico» (originado en la Universidad de Arizona)
Versión local en español de las secciones
- Bioquímica (completa)
- Biología Molecular (completa)
- Biología Humana ("ADN en medicina legal")
Traductores: Angel Herráez, Mª Cristina Tejedor y Pilar Sancho (UAH), Isabel Carrero (UVa), Jesús Salgado (UV). |
| G.
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Estudio de los ácidos nucleicos
Análisis electroforético de DNA plasmídico
(Comentario guiado)
- Plásmidos, su superenrollamiento y su análisis mediante electroforesis.
- Digestión parcial de un plásmido usando enzimas de restricción y análisis electroforético.
- Interpretación de los geles e introducción a la elaboración de un mapa de restricción.
Superenrollamiento del DNA
(Módulo de aprendizaje activo, nivel medio y avanzado)
y enlaces cruzados a material dentro de otras secciones de Biomodel. |
| H.
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Estructura del agua: enlaces de hidrógeno
Enlaces en el agua y en el hielo.
Simulación de la condensación de moléculas de agua en una gotícula.
Simulación de la transición agua-hielo.
Incluye un modelo molecular animado, generado mediante minimización energética.
 Este módulo (v.1) ha sido incluido (en español y en inglés) en BioMolecular Explorer 3D, version 2, un sitio web y CD-ROM “diseñado para proporcionar a los profesores de biología en enseñanza secundaria un fácil acceso a estructuras tridimensionales interactivas de moléculas biológicamente relevantes”.
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| I.
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Temas diversos
Radiactividad, ácido-base y oxidorreducción
Contenidos de los temas en forma de presentación, acompañados de actividades y ejercicios.
Elaborado en colaboración con la Universidad Nacional del Nordeste (Corrientes, Argentina)
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| L.
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Laboratorios virtuales
Simuladores de técnicas de laboratorio
- Ejercicios de autoevaluación sobre procedimientos básicos de cálculo en el laboratorio: diluciones, conversión de unidades, absorbancia y concentración.
- Simuladores de electroforesis
- de proteínas en gel de poliacrilamida con SDS (SDS-PAGE)
- de proteínas plasmáticas sobre acettao de celulosa
- de DNA en gel de agarosa
- de DNA en gel de poliacrilamida para secuenciación
- Laboratorio virtual de biología molecular
- digestión de DNA con enzimas de restricción
- análisis electroforético de los fragmentos
- secuenciación de DNA por el método de didesoxinucleótidos
- Simulador de espectros de dicroísmo ciruclar de proteínas, en función de su estructura secundaria
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| X.
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Ejercicios de autoevaluación
1) de estereoisomería: véase más arriba
2) véase también “El Proyecto Biológico”
3) Preguntas, ejercicios y problemas, con respuestas y comentarios, correspondientes a las asignaturas de la Licenciatura en Farmacia, en la Universidad de Alcalá: Biología Molecular e Ingeniería Genética y Bioquímica Clínica y Patología Molecular Humana.
Puedes encontrarlos en la página web del Departamento: |
| Y.
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Colección de enlaces para bioquímica
y biología molecular
Enlaces a páginas web útiles para la enseñanza y el
aprendizaje de la Bioquímica y Biología Molecular.
(Esta colección de enlaces es una parte del proyecto
BioROM) |
| Z.
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Protein Explorer en español
Potente programa de uso sencillo para investigar la estructura de macromoléculas.
Copyright © 2004 Eric Martz, traducido al español por Gabriel
Pons. |
| Ideas para el futuro: |
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Proteínas gigantes
Estructura de glúcidos
... ¿Alguna sugerencia? |
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| Enlaces externos recomendados: |
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El lenguaje científico:
1. Vocabulario inglés-español de bioquímica y biología molecular
(G. Claros, V. Saladrigas y D. González-Halphen)
2. Normas para la escritura científica en español
(G. Claros)
3. Colección de acrónimos
(E. Castro)
 4. Ideas, reglas y consejos para traducir y redactar textos científicos en español
(G. Claros)
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Cómo utilizar Jmol para estudiar y presentar estructuras moleculares. Volumen 1: aprendiendo a usar Jmol (niveles básico e intermedio)
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Texto
Ilustrado de Biología Molecular e Ingeniería Genética:
Conceptos,
Técnicas y Aplicaciones en Ciencias de la Salud
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| Sede web
del Departamento de Bioquímica y Biología Molecular |
|
| Sede web
de la asignatura Biología Molecular e Ingeniería Genética |
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| BioROM |
«Índice mundial
de recursos de visualización molecular»
(Eric Martz y Trevor D. Kramer) |
«Aula
Virtual
de Biología Molecular y Bioquímica»
(Gonzalo Claros y José Luis Urdiales, Univ. Málaga) |
«Modelos moleculares»
(Enrique Battaner, Univ. Salamanca)
|
«Estructura
de macromoléculas»
(Jesús Sanz, Univ. Miguel Hernández, Elche) |
«Alguna Bioquímica
en la Red»
(José Miguel Fernández, Univ. Granada) |
«Aula Virtual de Biología»
(Univ. Murcia) |
Modelo molecular «Insulina»
(Janneth Vásquez, Academia Colombina de Ciencias
Exactas, Físicas y Naturales) |
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(Alcalá de Henares, Madrid, España)
Biomodel-3 ha recibido un tercer premio en el concurso 2006 del Ministerio de Educación y Ciencia de España para materiales educativos curriculares en soporte electrónico que puedan ser utilizados y difundidos en internet.